Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rps3P62908 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rps3P62908 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms