Protein–RNA interactions for Protein: P59110

Senp1, Sentrin-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp1P59110 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Senp1P59110 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms