Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Usp25P57080 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Usp25P57080 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp25P57080 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms