Protein–RNA interactions for Protein: P56389

Cda, Cytidine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CdaP56389 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CdaP56389 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CdaP56389 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CdaP56389 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CdaP56389 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CdaP56389 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CdaP56389 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CdaP56389 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
CdaP56389 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CdaP56389 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CdaP56389 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CdaP56389 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms