Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
NcanP55066 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NcanP55066 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NcanP55066 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NcanP55066 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms