Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RabggtbP53612 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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RabggtbP53612 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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RabggtbP53612 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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RabggtbP53612 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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RabggtbP53612 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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RabggtbP53612 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RabggtbP53612 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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RabggtbP53612 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RabggtbP53612 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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