Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cux1P53564 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cux1P53564 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms