Protein–RNA interactions for Protein: P52651

Rhox5, Homeobox protein Rhox5, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox5P52651 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox5P52651 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms