Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

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Length 132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cxcl5P50228 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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