Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptpn1P35821 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms