Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gja1P23242 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms