Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SftpcP21841 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
SftpcP21841 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms