Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Klra1P20937 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klra1P20937 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klra1P20937 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms