Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Fcer1aP20489 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Fcer1aP20489 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms