Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NefhP19246 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NefhP19246 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NefhP19246 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms