Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcna1P16388 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcna1P16388 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcna1P16388 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Kcna1P16388 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcna1P16388 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms