Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Calb1P12658 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms