Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TnfP06804 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TnfP06804 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TnfP06804 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TnfP06804 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms