Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc4a1P04919 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms