Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P04214 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P04214 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P04214 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04214 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04214 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P04214 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P04214 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P04214 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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