Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GzmbP04187 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
GzmbP04187 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
GzmbP04187 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms