Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Krt10P02535 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Krt10P02535 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Krt10P02535 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms