Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
P01748 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
P01748 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
P01748 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01748 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P01748 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P01748 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms