Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
P01747 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
P01747 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
P01747 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms