Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Casp8O89110 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Casp8O89110 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms