Protein–RNA interactions for Protein: O89017

Lgmn, Legumain, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgmnO89017 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LgmnO89017 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LgmnO89017 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms