Protein–RNA interactions for Protein: O88623

Usp2, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2, mousemouse

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Length 613 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp2O88623 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp2O88623 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usp2O88623 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp2O88623 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp2O88623 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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