Protein–RNA interactions for Protein: O88396

Grpel2, GrpE protein homolog 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grpel2O88396 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Grpel2O88396 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Grpel2O88396 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms