Protein–RNA interactions for Protein: O88307

Sorl1, Sortilin-related receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorl1O88307 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sorl1O88307 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms