Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Vamp4O70480 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vamp4O70480 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms