Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Xirp1O70373 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Xirp1O70373 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms