Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nptx2O70340 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nptx2O70340 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms