Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ldb2O55203 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Ldb2O55203 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ldb2O55203 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ldb2O55203 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ldb2O55203 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ldb2O55203 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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