Protein–RNA interactions for Protein: O55176

Pja1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja1O55176 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Pja1O55176 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja1O55176 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pja1O55176 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms