Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Copb2O55029 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copb2O55029 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Copb2O55029 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms