Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
DffbO54788 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
DffbO54788 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
DffbO54788 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DffbO54788 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
DffbO54788 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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