Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
CrxO54751 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
CrxO54751 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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CrxO54751 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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CrxO54751 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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CrxO54751 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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CrxO54751 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
CrxO54751 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
CrxO54751 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CrxO54751 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CrxO54751 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CrxO54751 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CrxO54751 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CrxO54751 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
CrxO54751 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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