Protein–RNA interactions for Protein: O35942

Nek2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek2O35942 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nek2O35942 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nek2O35942 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms