Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ccl25O35903 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ccl25O35903 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ccl25O35903 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ccl25O35903 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ccl25O35903 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ccl25O35903 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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Ccl25O35903 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccl25O35903 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Ccl25O35903 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ccl25O35903 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms