Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Sp100O35892 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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