Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Timm44O35857 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms