Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Klf9O35739 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Klf9O35739 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Klf9O35739 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms