Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Stag2O35638 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms