Protein–RNA interactions for Protein: O35595

Ptch2, Protein patched homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptch2O35595 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ptch2O35595 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptch2O35595 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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