Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Srsf5O35326 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms