Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pkd2O35245 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Pkd2O35245 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pkd2O35245 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pkd2O35245 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Pkd2O35245 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkd2O35245 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Pkd2O35245 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Pkd2O35245 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Pkd2O35245 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms