Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ArxO35085 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ArxO35085 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ArxO35085 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ArxO35085 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms