Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Casq1O09165 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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