Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Eftud2O08810 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Eftud2O08810 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms