Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sema3aO08665 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sema3aO08665 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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